Ниндзя ежедневно уделяет по нескольку часов на тренировки и это необходимо, чтоб не потерять форму и в критический момент не ударить в грязь лицом. Герой игры Jungle Runner — умелый и опытный воин, но тренировки его уже не удовлетворяют, они даются ему слишком легко, а значит он не развивается. Поэтому герой решил отправиться в джунгли и устроить вертикальную пробежку по деревьям. Герой будет мчаться вверх с потрясающей скоростью, а ваша задача — контролировать, чтобы он ни чем и ни с кем не столкнулся. Оказывается наш ниндзя не одинок в джунглях, кроме того ему попытаются помешать пчёлы мутанты в Jungle Runner.