Путешествуя по Галактике исследователь по имени Том постоянно встречает различные древние артефакты. Что бы ваш герой смог добраться до них ему нужно решить различные головоломки. Вы в игре Puzzle Galaxies будете помогать ему в этом. Перед вами на экране будет видна конструкция, которая состоит из кубиков. Каждый из них будет разбит внутри на равное количество квадратных зон. В каждой зоне вы будете видеть шарик определенного цвета. С помощью клавиш управления вы будете вращать в пространстве кубики вокруг своей оси. Ваша задача выставить данные предметы так, что бы все шарики расположились в определенной последовательности. Как только вы это сделаете вам в игре Puzzle Galaxies дадут определенное количество очков и вы перейдете на следующий уровень игры.