Обычная ежедневная прогулся с питомцем в Dogs vs Aliens завершилась совершенно неожиданно. Хозяин собаки мирно сидел на скамейке, а его пёс играл рядом на лужайке. Появился какой-то странный звук, затем над питомцем появилась тень и собака поднялась в воздух. Герой сначала опешил, но быстро взял себя в руки и помчался в сторону, куда полетел его питомец. Вскоре пёс был найден, он сидел в клетке, которую вы легко сможете разрушить. Оказывается, животное похитили инопланетные пришельцы. Они панически бояться собак и для того, чтобы напасть и захватить Землю им нужно избавиться от питомцев. Вы должны это предотвратить, освобождая собак и превращая их в грозную армию против пришельце в Dogs vs Aliens.
