Сталкивая между собой большие разноцветные кубы в Mega Cube 4096 вы должны в конечном итоге получить мега куб с числовым значением 4096. Для выполнения задачи выбрасывайте кубики с номерами на игровое поле небольшого размера продолговатой формы. Не волнуйтесь за то, что кубы могут выпасть за пределы поля, этого не произойдёт. Во время столкновения двух блоков с одинаковым номером, произойдёт небольшой взрыв и вместо двух появится блок с номером, умноженным на два. Если поле будет забито блоками, а вы не успели получить мега блок, игра Mega Cube 4096 будет закончена, но не выиграна.