Рыб, которые летают не существует в природе, однако некоторые рыбы выпрыгивают из воды довольно высоко и их называют летающими. Наша рыбка, героиня игры Flapy Fish не отличается подобными навыками, она обычная рыбка, которая плавает в глубинах океана и пытается выжить в суровом подводном мире. Вы встретите её в сложный период её жизни. Рыбка покинула родные места, чтобы найти что-то получше. Там, где она обитала до последнего времени начались военные действия и стало неспокойно. Поэтому рыбка отправилась в долгий путь. Вы поможете ей преодолеть преграды, на е ё пути попались руины подводного города, которые нужно ловко обойти в Flapy Fish.