У Соника появилась возможность разделаться со своим давним врагом Наклзом. Синий ёж получил неожиданною информацию о местонахождении соперника и намерен туда отправиться. Вместе с другом и помощником Тейлзом герои отправятся на остров на самолёта. После приземления они встретят Наклза, но он быстренько смоется. Вы должны помочь Сонику и его другу преследовать злодея. Он расставил на острове массу ловушек, чтобы его никто не смог догнать, однако Соника не остановить, а вы будете строго контролировать перемещение героя, не давая ему напороться на острые шипы. Собирайте кольца, они всегда пригодятся герою в Sonic 3 & Knuckles.
