Миграция птиц — это ежегодный перелёт птиц в тёплые края. Как только наступает осень, многие виды птиц отправляются на юг, чтобы пережить холодную зиму. Утки — одни из них и в игре вы будете помогать одной уточек преодолеть нелёгкий перелёт. Но прежде вам нужно выбрать персонажа из представленных в игре героев: Пэм, Мак, дядя Дэн, Гвен и Дакс. Любой из них будет повиноваться вашему управлению. Сюжетзв Migration Flappy Duck заключается в том, что ваша птица отстала от стаи. Когда отлетали все сородичи, у неё было повреждено крыло, но сейчас оно зажило и можно попытаться догнать стаю, чтобы лететь вместе. Но прежде придётся преодолеть массу преград и усиленно махать крыльями без передышки в Migration Flappy Duck.
