В Матрице было создано несколько прототипов и один из них под номером 09435 оказался самым удачным. Это цифровой мальчик, который начал удивительным образом быстро развиваться и вскоре ему захотелось исследовать внешний мир. Он нашёл способ покинуть матрицу и отправился у путь в Prototype Guy. Создатели решили не мешать парню, они просят вас помочь ему адаптироваться, преодолевая преграды. Необходимо перепрыгивать через острые шипы и квадратных роботов. Кстати, роботов можно уничтожить, если прыгнуть непосредственно на них сверху. Если преграда не будет преодолена, герой начнёт путь сначала в Prototype Guy.