Апокалипсис может произойти от разных причин, в игре Apocalypse Run вы будете помогать герою, который оказался в центре апокалипсиса, появившегося в результате восстания машин. Искусственный интеллект, появление которого так ждали и так восхищались его быстрым развитием, решил, что люди теперь ему не нужны. Мало того, они даже вредны, потому что всё делают не так как нужно, ведут себя зачастую иррационально, уничтожают окружающую среду и убивают себе подобных. В разуме машины сформировалось стойкое убеждение, что человек — это главное зло на планете и его нужно уничтожить. Так началось планомерное уничтожение человечества, а герой Apocalypse Run хочет этого избежать и вы поможете ему бороться с роботами.
