В сторону небольшого поселения расположенного в Японии двигается отряд разбойников. Они хотя убить местных жителей и разграбить деревню. На защиту местных жителей встал отважный воин ниндзя. Вы в игре Phase Ninja будете помогать герою сражаться против злодеев. Перед вами на экране будет видна местность в которой будет находиться ваш персонаж. В его сторону будет двигаться отряд противника. С помощью различного метательного оружия и лука со стрелами вы сможете уничтожать противников на дистанции. Когда враг приблизится вплотную, вы обнажив меч вступите в ближний бой. Нанося удары мечом по противнику вы будете уничтожать их и получать за это очки. После смерти врагов вы сможете подбирать трофеи, которые будут выпадать из них.