Мир желейных обитателей велик и разнообразен и среди них есть клан воинов ниндзя. Они отличаются от обычных желеек чёрной повязкой, при этом сами могут быть любого цвета. Этот клан и бросает вам вызов в игре Jelly Ninja. Вам остаётся лишь выбрать режим игры: на время или против ошибок. Временной режим предполагает, что вы играете одну минуту, но она может продлиться, если вы поймаете летающий будильник. В режиме без ошибок, вы будете играть, пока шкала справа не станет полностью красной, а это случится, если вы пропустите определённое количество желеек, не успев их разрезать. Есть немало желейных ниндзя, которых не победить с одного взмаха меча.
