Отважный ниндзя Киото приехал в Америку что бы отыскать врагов своего ордена и уничтожить их. Вы в игре Ninja Run поможете нашему герою в этом. Он смог выследить где расположились его враги и с наступлением ночи отправился к их логову. Нашему герою предстоит пробежать по крышам домов определенное расстояние. Между крышами будут видны провалы самых различных размеров. Вы управляя своим героем должны будете на скорости все их перепрыгнуть. Если вам повстречаются войны противника вы сможете убить их при помощи своего верного меча.