В омнитриксе Бена случился сбой и ДНК всех загруженных в нём существ перепутались. Это так некстати, потому что враг не дремлет и уже начинает атаку, вам необходимо в Ben 10 Dna Decode провести декодировку. Берите пары существ, переносите их в специальные аппараты, которые соединят их одна, а вы замените некоторые части тела, чтобы вернуть инопланетянину его прежний вид. Когда герой будет исправлен, отправляйтесь на битву. Перемещайте героя, чтобы он обстреливал противника, не давая ему добраться до конца дорожки. Действуйте быстро и ловко. В игре вам понадобится не только сноровка, но и логическое мышление.