Среди ниндзя, как и среди обычных людей попадаются плохие парни и герою из игры Ninja Fighter как раз с ними и придётся сражаться. Он не одинок, имеются добровольные помощники и они будут прибывать. Но главная надежда на героя, которым вы будете управлять. Он сильнее, ловчее и за ним пойдут все остальные. Выискивайте врагов и уничтожайте их. Они сильны и владеют теми же секретами, что и самые продвинутые ниндзя. Но их слабость состоит в том, что они злые и беспринципные, а добро всегда побеждает зло. Управляйте стрелками, нарисованными внизу экрана, если играете на устройстве с сенсорным экраном. При наличии клавиатуры воспользуйтесь клавишами ASDW.