Существует целый культ, где маленькие мальчики изучают искусство ниндзя. Это очень сложный путь, который требует не только хорошей физической подготовки, но и силы духа. Соблюдать все законы кодекса ниндзя, может не каждый. В игре Ninja Boy, вы познакомитесь с Куном, мальчиком, который решил посвятить свою жизнь кодексу ниндзя. Вчера, на его школу было совершено нападение. Нападавшие, это не люди, а какие-то, очень странные монстры. Они похитили все сокровища школы ниндзя. Теперь, только Кун может вернуть украденное, но, ему нужна ваша помощь. Вы должны направлять его так, чтобы он, за минимальное количество ходов, убил монстров и вернул сокровища.